您好，感谢您的邀请。
1）关于行程
您的行程总体不错。有些地方稍微调整一下，就会更加完美。
D2：顺序调整为南京博物院-总统府-东南大学四牌楼校区。南京师范大学绥远校区毗邻先锋书店五台山店，因此调整为D4下午或D5上午。除此之外，南邦还有很多值得一看的地方。仔细品尝至少需要4个小时，所以东大大学和鸡鸣寺也可以一天逛完。两者仅一站之遥，可乘坐公交车304路连接。
D3：这一天的行程全部在中山风景区内，主要景点都有内部交通相连。建议选择中山陵、明孝陵、灵谷寺三座中的两座。音乐台和美龄宫都离中山陵不远。美龄宫强烈推荐。
D4：行程顺序调整为：鸡鸣寺-玄武湖-狮子桥美食街。如果有兴趣，也可以参观鸡鸣寺后前往台城，然后从旁边的解放门进入玄武湖。参观玄武湖正门玄武门，然后步行至狮子桥美食街。

2）推荐酒店：
一家金泰隆国际酒店：
靠近地铁2号线大行宫站和1号线新街口站，楼下有几家餐厅，包括对面也有。全民健身中心及其旁边的友福西街。酒店对面就有公交车站，非常方便。酒店距新街口、总统府仅一站之遥。附近有家乐福超市。酒店环境很好，价格一般在300元一晚左右。
B Gunandu BenQ酒店：
只有几百米距玄武湖风景区正门仅数米之遥。门口就有地铁1号线，多条公交车。位于玄武湖公园和狮子桥美食街之间，金茂汇对面。南京独排洞等多家餐厅和小吃供您选择，金茂汇一楼还有北京华联的BHG超市。酒店属于古南都集团，历史悠久，各方面都不错。价格每晚250元左右。
南京新纪元C酒店：距离南京大学鼓楼校区约700米，位于地铁1号线珠江路站和鼓楼站之间（貌似离珠江路站较近）。酒店外卖部的糕点和美食很好吃。附近的丹凤街有金润发超市，小吃也很多。紧邻紫峰大厦、江苏广电荔枝广场、金鹰世界等，购物餐饮齐全NG设施。门口步行5分钟内有多条公交车，交通便利。价格在230元左右。

南京有很多各种类型、档次的酒店。我们推荐三家酒店供您参考。一般离地铁近的比较方便。如果还有疑问，欢迎再次沟通。

3）从南博或总统府到东南大学四牌楼校区和南京师范大学绥远校区的交通：
公交车201路到中山门站（南博）和总统府站（总统府）皇宫））、四牌楼站（东南大学四牌楼校区）；如果去南京师范大学，在总统府换乘3路公交车到南阴阳营即可。

4）推荐南京其他有代表性的景点
明城墙：正在与其他城市的古城墙连接起来n 申请遗产。春节期间，各大城墙上都挂上了春联，十分喜庆
B 颐和路：南京最美的民国路
C 滨江风景带：靠近中山码头，靠近狮子山阅江楼景区
D爱国主义教育基地：侵华日军南京大屠杀遇难同胞纪念馆、雨花台烈士陵园

5）推荐二手书店、二手书市场南京：
杨公井古籍书店原位于老中华书店。
靠近台大宿舍区的广州路上有一两家旧书店。我不知道他们现在是否还在。朝天宫附近以前有一个，不过现在好像搬走了。另外，南京有24小时的南自习室，不过春节期间会休息一段时间。你什么时候来南京？还有一家书店位于武定门城墙内——金陵书院，非常有特色！

6）推荐每日行程中的特色小吃和餐食：
D1：莲湖饼店、永和花园、七芳阁
D2：总统府附近的1912历史文化区（中高） -结束 以餐饮为主）和科巷文昌巷的鸿福面、福印栗子、脆皮烧饼等
D3：南京排东紫兰里街的芝士时光苜蓿园地铁站旁，附中山大学-森陵青年旅社餐厅
D4：狮子桥天长猪里脊肉、鸡鸣汤包、韩复兴、小熊糖葫芦
D5：南京师范大学对面的金良酸菜鱼、吴家煎包

希望这可以帮助你。如果您有任何疑问，请随时询问。
祝您南京之旅愉快！